Witam...

Mam problem z pewnym zagadnieniem i nie moge nic na ten temat znalezc w Internecie, wiec postanowilam zapytac

Nie mam pojecia, jak przeprowadzic dysocjacje dipeptydu lub tez polipeptydu. np majac dipeptyd Asp-Phe, jak nalezy przeprowadzic jego dysocjacje w kolejnych etapach? Na ktore odszczepiajace grupy nalezy po kolei patrzec? Czy nalezy isc tak samo jak w jednym aminokwasie od dysocjacji tych grup, ktore maja najnizsze pH? I jak rozwiazac problem tego, ze Asp ulega 3 dysocjacjom, a Phe dwom...
No i potem jak poradzic sobie z narysowaniem takiej krzywej miareczkowania i okreslic punkt rownowagi ? Nie mam pojecia, moze ktos wie?

kasica napisał/a

Witam... Mam problem z pewnym zagadnieniem i nie moge nic na ten temat znalezc w Internecie, wiec postanowilam zapytac :) Nie mam pojecia, jak przeprowadzic dysocjacje dipeptydu lub tez polipeptydu. np majac dipeptyd Asp-Phe, jak nalezy przeprowadzic jego dysocjacje w kolejnych etapach? Na ktore odszczepiajace grupy nalezy po kolei patrzec? Czy nalezy isc tak samo jak w jednym aminokwasie od dysocjacji tych grup, ktore maja najnizsze pH? I jak rozwiazac problem tego, ze Asp ulega 3 dysocjacjom, a Phe dwom... No i potem jak poradzic sobie z narysowaniem takiej krzywej miareczkowania i okreslic punkt rownowagi :|? Nie mam pojecia, moze ktos wie?

Miareczkowanie i obliczenia z serii kwas-zasada dla peptydów można zrobić tak samo jak dla kwasów wieloprotonowych. Należy pamiętać, iż grupa karboksylowa z danego aminokwasu "użyta" do stworzenia wiązania peptydowego nie będzie dostępna do miareczkowania i nie będzie odszczepiała protonu.
Asp-Phe: HOOCCH2CH(NH2)CONHCH(CH2Ph)COOH. Grupa karboksylowa przy fenyloalaninie pKa,1 ok. 2, grupa karboksylowa od kwasu asparaginowego pKa,2 ok. 4, grupa NH2 (NH3+) przy kwasie asparaginowym pKa,3 ok. 10.