Europejska infrastruktura biobanków w prototypie systemu do 2010 r. :: Artykuły / Polski Serwis Naukowy

Polecamy również:

Zaproszenie do składania ofert na badanie korzyści z realizacji unijnych celów dotyczących bioróżnorodności oraz określenia brakujących kwalifikacji obecnie dostępnych kadr

"Profesor od bocianów" pokazuje świat niewidomym

W Olsztynie profesor z Chorwacji "pokazał" niewidomym muszle

Opracowanie zasobów dotyczących przetwarzania siatkowego

Rola biobanków w badaniach nad różnorodnością lasów i ich ochronie, Viterbo, Włochy

Nowy serwis udostępnia informacje o projektach w portalu CORDIS

Infrastruktura Biobanków i Zasobów Biomolekularnych (BBMRI) zrobiła milowy krok naprzód wraz z zakończeniem przeglądu ponad 300 głównych biobanków europejskich. Kierownicy projektu, profesor Kurt Zatloukal z Akademii Medycznej w Grazu, Austria, i profesor Eero Vuorio z Uniwersytetu w Turku, Finlandia rozmawiali z CORDIS News o aktualnych działaniach BBMRI zmierzających do udostępnienia naukowcom łącznej zawartości biobanków oraz opracowania prototypu systemu, który jak mają nadzieję, będzie operacyjny przed końcem 2010 r.

Etap przygotowawczy BBMRI jest finansowany na kwotę 5 mln EUR z Siódmego Programu Ramowego (7PR) UE jako jedna z wielu ważnych infrastruktur badawczych o zasięgu paneuropejskim. Celem BBMRI jest zapewnienie naukowcom dostępu do ogólnoeuropejskiego zbioru biomedycznych próbek i danych sprawdzonych pod względem jakości, które będzie można wykorzystywać do opracowania terapii i profilaktyki chorób człowieka.

"Po raz pierwszy dysponujemy realną mapą, czy też krajobrazem, rodzajów zasobów, jakie są faktycznie dostępne w Europie" - powiedział profesor Zatloukal o niedawnym przeglądzie biobanków. Tworząca się infrastruktura badawcza obejmuje 51 instytucji uczestniczących i 190 organizacji stowarzyszonych, które w sumie reprezentują 30 państw unijnych i krajów stowarzyszonych.

Kolejnym krokiem w projekcie jest opracowanie prototypowego systemu we współpracy z najbardziej zaawansowanymi biobankami, które stwarzają najmniej trudności, po czym dołączanie kolejnych, kiedy będą gotowe. Partnerzy projektu spodziewają się, że prototyp, który wypełni lukę między etapem planowania a wdrażania, będzie funkcjonować przed końcem 2010 r.

"To jedna z tych dziedzin, w której Europa wyraźnie wyprzedza wszystkich swoich konkurentów" - powiedział profesor Vuorio. "Dysponujemy większą liczbą próbek i danych je opisujących niż jakikolwiek inny obszar na świecie. Europa ma długą tradycję gromadzenia próbek, co stanowi jej główną przewagę. Prawdziwym celem jest teraz postarać się, aby jak najlepiej wykorzystać posiadaną przewagę."

"Mamy znakomite możliwości w Europie, ponieważ wszystkie sześć infrastruktur nauk przyrodniczych, znajdujących się obecnie na etapie przygotowawczym, w tym także te włączone do nowej mapy drogowej, posiada duże możliwości synergii" - dodał profesor Zatloukal. Na przykład każda infrastruktura wymaga rozwiązań w zakresie bioinformatyki, a większość z nich potrzebuje biobanków, w czym może pomóc BBMRI. Infrastruktury mogą mieć "znaczny wpływ na zwiększenie europejskiej konkurencyjności w globalnym kontekście" - jak mówi.

Profesor Vuorio podkreślił wagę odpowiedniego kodowania wszystkich próbek, aby chronić prywatność pacjentów, gdyż naukowcy - jak zauważył - są zainteresowani dużymi grupami, a nie pojedynczymi osobami. "Musimy usunąć wszystkie identyfikatory, aby naukowcy nie byli w stanie określić tożsamości [ďż˝] osoby, która jest źródłem próbek przeznaczonych do badań" - dodaje profesor Zatloukal. Celem jest zebranie wysoce rozproszonych danych, które są gromadzone w szpitalach uniwersyteckich i państwowych ośrodkach badawczych oraz zapewnienie powszechnego dostępu do nich. Interfejs internetowy wykorzystywany przez naukowców, którzy planują swoje projekty, udostępniać będzie wyłącznie dane dotyczące grup osób o tej samej charakterystyce - zauważył - a nie informacje związane z konkretną osobą.

Odnosząc się do wyzwań, jakie stają obecnie przed partnerami projektu, profesor Vuorio powiedział: "Co zaskakujące, kwestie techniczne są najprostsze". Jednym z głównych wyzwań informatycznych jest maksymalizacja wartości próbek poprzez przypisanie im jak największej możliwej liczby istotnych informacji, co nie jest proste, ponieważ próbki zebrane dawno temu mogą nie być opatrzone danymi, które obecnie uznano by za kluczowe. "Robiono to na różne sposoby w różnych krajach i zazwyczaj w miejscowym języku" - wyjaśnił profesor Vuorio. Kolejnym problemem jest stworzenie zharmonizowanej bazy danych, wykorzystującej informacje przechowywane w systemach, które nie są obecnie kompatybilne.

Ocena jakości samych próbek, aby można je było jak najlepiej wykorzystać, stanowi kolejne, poważne przedsięwzięcie. "Standaryzacja i ujednolicenie to kluczowe cele techniczne" - wyjaśnił profesor Vuorio. Poczynając od zbierania próbek wszystkie uczestniczące biobanki muszą uzgodnić standardowe sposoby postępowania z materiałem od samego początku. Co zaś się tyczy istniejących próbek, trudno jest zyskać dokładne informacje, jaki tryb postępowania z 20-letnimi próbkami przyjęto na początku.

Niemniej największe trudności wiążą się z harmonizowaniem znacznie różniących się od siebie wymagań etycznych i prawnych poszczególnych państw członkowskich. Edukacja w zakresie badań biomedycznych i postaw różni się w poszczególnych krajach, podobnie jak interpretacje prawodawstwa unijnego takiego jak dyrektywa o ochronie danych osobowych. Co istotne, konieczne jest uzyskanie "świadomej zgody" każdej osoby, która jest dawcą próbek przeznaczonych do dalszych badań, a trudno powiedzieć, w jaki sposób próbki te zostaną wykorzystane w przyszłości. "Musimy teraz zebrać próbki, które stanowić będą podstawę do badań przez kolejne 10 do 20 lat - powiedział profesor Vuorio - ale trudno jest przewidzieć, co okaże się istotne."

"Sądzę, że [nikt] z nas nie posiada wyraźnej wizji nauki za 20 lat" - dodaje profesor Zatloukal. "Potrzebujemy dobrej struktury zarządczej, aby zintegrować tak wysoce rozproszoną infrastrukturę i zarządzać nią, zapewniając jej jednocześnie elastyczność wystarczającą do reagowania na nowe wyzwania i pojawiające się potrzeby."

Aby lepiej zrozumieć, w jaki sposób opinia publiczna w różnych częściach Europy postrzega badania biomedyczne, BBMRI prowadzi prace w grupach roboczych i włączyła podstawowe pytania dotyczące biobanków do ostatniej ankiety Eurobarometru. Ważne spotkanie zainteresowanych stron, w tym przedstawicieli organizacji pacjentów, stowarzyszeń medycznych i przemysłu medycznego, odbędzie się w Brukseli we wrześniu.

Źródło: CORDIS

Więcej informacji:

Infrastruktura Biobanków i Zasobów Biomolekularnych (BBMRI):
http://www.bbmri.eu/

Siódmy Program Ramowy: Infrastruktury badawcze:
http://cordis.europa.eu/f...uctures_en.html

Źródło danych: Wywiad CORDIS News z Kurtem Zatloukalem i Eero Vuorio
Referencje dokumentu: Na podstawie wywiadu CORDIS News z Kurtem Zatloukalem i Eero Vuorio

komentuj publikację

Czy wiesz że...?

wersja BETA

Polska Infrastruktura Gridowa PL-Grid, ogólnopolska infrastruktura obliczeniowa, zbudowana w latach 2009-2011, w ramach projektu naukowego PL-Grid - Polska Infrastruktura Informatycznego Wspomagania Nauki w Europejskiej Przestrzeni Badawczej. Celem jej budowy było umożliwienie przeprowadzania badań naukowych w oparciu o symulacje i obliczenia dużej skali z wykorzystaniem klastrów komputerowych oraz zapewnienie wygodnego dostępu do zasobów komputerowych dla zespołów badawczych także spoza środowisk, w których działają centra Komputerów Dużej Mocy (KDM). pełny tekst

CORDIS (Community Research and Development Information Service), Wspólnotowy Serwis Informacyjny Badań i Rozwoju jest bazą informacji na temat europejskiej działalności badawczo-rozwojowej. Stanowi oficjalne źródło informacji na potrzeby publikacji wszystkich zaproszeń do składania wniosków w ramach siódmego programu ramowego w dziedzinie badań i rozwoju technologicznego (7PR). CORDIS jest jednym z serwisów wydawnictwa Unii Europejskiej Urzędu Oficjalnych Publikacji Wspólnot Europejskich. pełny tekst

Program usługowy koncepcja i termin określający komponowanie i organizację powiązanego funkcjonalnie obszaru przestrzeni publicznej rozumianego jako obiekty infrastruktury łącznie z ich funkcjami (oferowanymi usługami). Odnoszone jest to też do pojedynczej budowli w kontekście jest części, np. lokali usługowych, handlowych, garaży, spa itd. pełny tekst

RailNetEurope (RNE) stowarzyszenie utworzone w 2004 przez większość europejskich zarządców infrastruktury kolejowej celem umożliwienia szybkiego i łatwego dostępu do europejskiej sieci kolejowej, jak również w celu zwiększenia jakości i efektywności międzynarodowego ruchu kolejowego. 38 członków RailNetEurope z 27 państw wspólnie harmonizują warunki i procedury w zakresie zarządzania międzynarodową infrastrukturą kolejową. Wspólne biuro stowarzyszenia mieści się w Wiedniu. pełny tekst

Produkt turystyczny wszystkie dobra i usługi nabywane przez konsumenta w związku z wyjazdem ze stałego miejsca zamieszkania, miejsca, atrakcje turystyczne, infrastruktura. pełny tekst

Urząd Oficjalnych Publikacji Wspólnot Europejskich (ang. Office for Official Publications of the European Communities - OPOCE) wydawnictwo instytucji i organów Unii Europejskiej podporządkowane Komisji Europejskiej, z siedzibą w Luksemburgu. Urząd przygotowuje i rozpowszechnia publikacje urzędowe, takie jak Dziennik Urzędowy UE, Budżet UE oraz Raport Generalny na temat działalności UE (przewidziane przepisami Unii), a także inne biuletyny informacyjne. Urząd prowadzi także kilka portali internetowych związanych z działalnością Unii (EUR-Lex, TED, SIMAP, CORDIS) oraz ma własną internetową księgarnię. pełny tekst

Moduł "Czy wiesz że...?" (wersja testowa, beta): definicje/pojęcia wygenerowane w obrębie tego modułu pochodzą z Wikipedii i udostępniane są na licencji Creative Commons: uznanie autorstwa, na tych samych warunkach, z możliwością obowiązywania dodatkowych ograniczeń. Dostęp do pełnej wersji każdego hasła (oraz dokładnch informacji na temat licencji, autora oraz edycji) możliwy jest po kliknięciu w odnośnik opisany jako "pełny tekst".