Naukowcy finansowani ze środków unijnych walczą z rakiem szyjki macicy :: Artykuły / Polski Serwis Naukowy

Polecamy również:

Michael Hanlon: "10 pytań, na które nauka nie znalazła (jeszcze) odpowiedzi" - recenzja

"Forum Akademickie" nagrodziło najciekawsze artykuły młodych naukowców

Konkurs dla naukowców-fotografów - "Nauka w obiektywie"

Naukowcy zaskoczeni pierwszą próbą "wielkiego zderzacza"

Polscy naukowcy nie muszą "jechać z tyłu"

Rak szyjki macicy jest drugim najczęściej występującym rodzajem raka na świecie. Każdego roku w samej tylko Europie chorobę tę diagnozuje się u około 60.000 kobiet, z czego około połowa przypadków okazuje się śmiertelna. Zduszenie choroby w zarodku jest trudne, jeżeli nie jest odpowiednio wcześnie wykryta i leczona. Finansowany ze środków unijnych na kwotę 2,63 mln EUR projekt ASSIST (Badania asocjacyjne wspierane przez technologie inferencyjne i semantyczne) ma na celu rozwiązanie tego problemu poprzez budowanie mostów technologicznych między ośrodkami medycznymi specjalizującymi się w diagnozowaniu i leczeniu raka szyjki macicy oraz wspieranie wymiany danych i rozbudowę magazynu danych.

Choć naukowcy przyznają, że wirus brodawczaka ludzkiego (HPV) jest głównym czynnikiem ryzyka w przypadku raka szyjki macicy, zgadzają się także z tym, że nie jest jednym. Naukowcy analizowali rolę konkretnych czynników genetycznych i środowiskowych w determinowaniu odporności HPV i późniejszego postępowania choroby. Wcześniejsze badania wskazywały na mechanizmy patogeniczne, które mogłyby dostarczyć nowych znaczników ryzyka, diagnozy i prognozy oraz ewentualnie poprowadzić do nowych celów terapii.

Projekt ASSIST zmierza do połączenia różnych rodzajów danych zebranych przez naukowców; zautomatyzowania procesu ewaluacji hipotez medycznych; stworzenia silnika inferencyjnego, który potrafi przetworzyć materiał od strony statystycznej; zebrania razem magazynów z danymi pacjentek instytucji uczestniczących w projekcie; oraz opracowania narzędzi graficznych dla naukowców prowadzących badania medyczne, aby za ich pomocą mogli zamieszczać swoje zapytania.

Naukowcy prowadzący projekty medyczne korzystają z badań asocjacyjnych w celu zidentyfikowania czynników, które są wspólne dla różnych chorób. Uwzględniają dane kliniczne z badań szpitalnych, dane nt. trybu życia (np. o paleniu tytoniu i sposobie odżywiania się) oraz dane genetyczne. Porównują również dane pacjentek z danymi kobiet zdrowych.

"Naszym celem jest umożliwić prowadzącym naukowe badania medyczne w specjalistycznych szpitalach i centrach medycznych wzajemny dostęp do swoich danych, które można połączyć w większy zbiór do wykorzystania podczas prowadzonych prac" - mówi profesor Pericles Mitkas z Centrum Badań i Technologii - Hellas, Instytut Informatyki i Telematyki, Grecja. "Problem w tym, że każdy szpital korzysta z różnych formatów, różnych reguł przechowywania danych, nawet w przypadku tych samych badań" - komentuje koordynator projektu. "Nawet w jednym szpitalu każdy lekarz może stosować własne praktyki w tym zakresie."

Jak zauważa profesor Mitkas, największym dotychczasowym sukcesem projektu ASSIST jest pogłębienie dialogu między lekarzami, biologami molekularnymi i informatykami. "Rozmawiają ze sobą i w końcu zaczynają wzajemnie rozumieć swoje technikalia" - wyjaśnia.

W pierwszej części projektu wzięły udział trzy szpitale - z Belgii, Niemiec i Grecji. Po uzgodnieniu wspólnej terminologii i sposobu przedstawiania danych i uzyskiwania do nich dostępu, zespół badawczy opracował prototypową platformę programistyczną, dzięki której naukowcy otrzymują dane w żądanym formacie. "Korzystamy z reprezentacji semantycznej, czyli przypisujemy interpretacje poszczególnym wartościom, aby umożliwić komputerowi zrozumienie, do czego odnosi się każda z nich" - mówi kierownik projektu.

"Stosujemy także interpretację wartości subiektywnych, jak np. wysokie lub niskie ryzyko czy poważny lub lekki przypadek, a także techniki inferencyjne, opierające się na zbiorze reguł medycznych podanych przez lekarzy, aby umożliwić komputerowi rozróżnienie, które wyniki są ważniejsze od innych" - dodaje. "Na przykład, wyniki biopsji będą bardziej rozstrzygające niż wyniki testu PAP i mogą wskazać na stan przedrakowy, którego PAP nie wykazał."

Prototypowa platforma ASSIST umożliwiła naukowcom dostęp do danych pacjentek z oddziałów ginekologicznych i położniczych trzech szpitali. "Ciągle dodajemy nowe funkcje, ale przynajmniej lekarze mają już teraz coś, z czym można pracować i co można analizować" - mówi profesor Mitkas.

"Wraz z rozwojem projektu, zrozumienie ścieżki choroby i czynników, jakie na nią wpływają, pomoże poszczególnym lekarzom na wcześniejszą diagnozę, profilaktykę poprzez udzielanie wskazówek pacjentkom, a także opracowanie leków i procedur terapeutycznych" - dodaje. "Ale ASSIST to przede wszystkim narzędzie dla naukowców prowadzących badania medyczne, których wyniki przyniosą pożytek wszystkim kobietom."

Więcej informacji:

ASSIST:
http://assist.ee.auth.gr/

CORDIS
url: http://cordis.europa.eu/f...SION=&RCN=30378
Źródło danych: Wyniki TIK
Referencje dokumentu: Na podstawie informacji uzyskanych z Wyników TIK

komentuj publikację

Czy wiesz że...?

wersja BETA

Ogólnopolska Organizacja na Rzecz Walki z Rakiem Szyjki Macicy "Kwiat Kobiecości" została założona w 2005 przez Idę Karpińską, stylistkę i wizażystkę, która przeszła chorobę nowotworową. Zrzesza kobiety, które chorowały, chorują lub mają jakąkolwiek inną styczność z rakiem szyjki macicy oraz specjalistów różnych dziedzin. W 2008 roku organizacja uzyskała status organizacji pożytku publicznego. Jest członkiem Europejskiego Stowarzyszenia Raka Szyjki Macicy ECCA (European Cervical Cancer Association). Podstawowy cel działań organizacji to podniesienie świadomości kobiet i ich rodzin na temat rak szyjki macicy. pełny tekst

Rak szyjki macicy (łac. carcinoma cervicis uteri, ang. cervical cancer) pierwotny nowotwór złośliwy szyjki macicy. Inwazyjnego raka szyjki macicy poprzedza stan zwany wewnątrznabłonkową neoplazją szyjki macicy (ang. cervical intraepithelial neoplasia, CIN, dawniej określany jako dysplazja szyjki macicy albo rak przedinwazyjny). CIN może ulegać progresji do raka inwazyjnego, sama nie stanowiąc zagrożenia dla zdrowia kobiety; stąd tak istotne jest wczesne wykrycie tych zmian w badaniu cytologicznym rozmazu z pochwowej części szyjki macicy. Zakażenie ludzkim wirusem brodawczaka (HPV) jest koniecznie do rozwinięcia się raka szyjki macicy prawie we wszystkich przypadkach. Dwa typy wirusa: 16 i 18 są odpowiedzialne za około 70% przypadków raka szyjki macicy. pełny tekst

Konizacja szyjki macicy metoda diagnostyczna lub diagnostyczno-lecznicza wycięcia stożka tkanki z części pochwowej szyjki macicy. Rutynowo wykonuje się po niej wyłyżeczkowanie kanału szyjki. Wskazaniem do konizacji jest nieprawidłowy obraz cytologiczny, nieprawidłowy obraz histologiczny pobranego wcześniej bioptatu części pochwowej szyjki lub nieprawidłowy wynik kolposkopii. pełny tekst

Skala Bishopa określa dojrzałość szyjki macicy do porodu naturalnego. Ocenia: położenie szyjki, konsystencję, ułożenie części przodującej płodu, rozluźnienie, rozwarcie. pełny tekst

Moduł "Czy wiesz że...?" (wersja testowa, beta): definicje/pojęcia wygenerowane w obrębie tego modułu pochodzą z Wikipedii i udostępniane są na licencji Creative Commons: uznanie autorstwa, na tych samych warunkach, z możliwością obowiązywania dodatkowych ograniczeń. Dostęp do pełnej wersji każdego hasła (oraz dokładnch informacji na temat licencji, autora oraz edycji) możliwy jest po kliknięciu w odnośnik opisany jako "pełny tekst".