Unijni naukowcy tworzą wirtualne laboratorium do leczenia HIV :: Artykuły / Polski Serwis Naukowy

Polecamy również:

Dwa leki w jednym w leczeniu obturacyjnej choroby płuc

Nowe leki na zaniedbane choroby, Modena, Włochy

Eksperci: leki homeopatyczne nie wywołują działań niepożądanych

Badania genetyczne budzą nadzieję na lepsze leczenie choroby Huntingtona

Choroby chrząstki stawowej coraz częstsze, nowe metody leczenia

Ziemiopłody odporne na suszę i choroby celem nowego projektu

Unijni naukowcy opracowali wirtualne laboratorium, aby pomóc lekarzom na całym świecie dopasować leki do potrzeb pacjentów i opracować skuteczniejsze metody leczenia HIV - wirusa wywołującego AIDS oraz inne choroby zakaźne. Źródłem unijnego wsparcia dla badań był projekt VIROLAB (Wirtualne laboratorium wspomagające proces decyzyjny w leczeniu chorób wirusowych), który otrzymał 3,3 mln EUR z tematu Technologie społeczeństwa informacyjnego (IST) Szóstego Programu Ramowego (6PR).

VIROLAB, którego udostępnienie w Internecie zaplanowano przed końcem 2010 r., wykorzystuje najnowsze osiągnięcia w uczeniu maszynowym, wybieraniu danych, informatyce sieciowej, modelowaniu i symulacji, aby przekuć treść milionów artykułów ukazujących się w czasopismach naukowych, baz danych i historii choroby pacjentów na wiedzę, którą można skutecznie wykorzystać do leczenia choroby.

Siedem szpitali już korzysta z wirtualnego laboratorium, aby zapewnić zindywidualizowane leczenie pacjentom zarażonym wirusem HIV i rozwiązanie to budzi powszechne zainteresowanie jako bardzo skuteczne narzędzie wspomagające proces decyzyjny lekarza.

"VIROLAB wyszukuje nowe ścieżki leczenia poprzez łączenie różnego rodzaju danych, począwszy od informacji genetycznych i interakcji molekularnych w organizmie mierzonych w nanosekundach, a skończywszy na socjologicznych interakcjach na poziomie epidemiologicznym, obejmując całe lata postępu choroby" - wyjaśnia Peter Sloot, naukowiec-informatyk z Uniwersytetu Amsterdamskiego w Holandii, koordynator projektu VIROLAB.

Wirus HIV, podobnie jak inne wirusy, stwarza ogromne problemy ze względu na częste mutacje i umiejętność szybkiego osiągnięcia odporności na leki. Dlatego lekarze muszą wiedzieć, które leki mogą być skuteczne w spowolnieniu postępu choroby, uwzględniając szczep wirusa, historię choroby pacjenta, informacje genetyczne, a nawet czynniki socjologiczne.

"To jak zamek i klucz" - mówi profesor Sloot. "Leki to klucze wykonane tak, aby pasowały do pewnych zamków, które są częścią wirusów. Jeżeli zmieniają się zamki, to klucze przestają pasować, a każdy zamek wygląda inaczej u każdego pacjenta. Dlatego potrzebna jest nam medycyna zindywidualizowana."

System stale przeszukuje połączone z siecią bazy danych wirusologicznych, immunologicznych, klinicznych, genetycznych i doświadczalnych oraz czerpie informacje z artykułów ukazujących się w czasopismach naukowych, jak również z innych źródeł. Następnie dane są przetwarzane, aby nadać im odczytywane maszynowo znaczenie semantyczne i analizowane w celu opracowania modeli prawdopodobnych skutków, jakie wywołają różne leki u danego pacjenta.

Każdy lek jest następnie klasyfikowany wedle przewidywanej skuteczności w świetle historii choroby pacjenta, a informacje są podawane za pośrednictwem prostego w użyciu interfejsu internetowego.

System odnotowuje wszystkie kroki podejmowane przez siebie i lekarza, aby znaleźć odpowiedni lek dla pacjenta i umożliwia porównanie z przypadkami innych pacjentów, którzy mogą mieszkać kilka ulic albo kilka tysięcy kilometrów dalej. Co więcej może wygenerować modele symulujące prawdopodobny proces rozprzestrzeniania się i postępu różnych mutacji wirusów na podstawie nie tylko danych medycznych, ale również informacji socjologicznej.

"Powiedzmy, że rząd może przeznaczyć 500 mln EUR na badania naukowe nad wirusem HIV i chce wiedzieć, czy powinny się one skupiać na finansowaniu opracowania nowych leków czy na działaniach prewencyjnych, my możemy powiedzieć, co będzie skuteczniejsze" - podkreśla profesor Sloot.

Jak mówi, skoncentrowanie się projektu na wirusie HIV wynika ze skali i wagi epidemii AIDS oraz bogactwa informacji na temat tej choroby. Odporność wirusa HIV na leki jest jednym z niewielu obszarów medycyny, w którym informacje genetyczne są szeroko wykorzystywane od wielu, wielu lat.

Profesor Sloot i inni partnerzy VIROLAB sprawdzają obecnie, w jaki sposób program mógłby zostać wykorzystany do tworzenia zindywidualizowanych rankingów leków, doskonaląc leczenie osób cierpiących na inne choroby. Badania te są prowadzone w ramach finansowanego ze środków unijnych projektu DYNANETS (Obliczanie cech rzeczywistych zjawisk w dynamicznie zmieniających się, złożonych sieciach), który bada dynamikę leków u osób zarażonych wirusem grypy H1N1 oraz koinfekcjami, obok odpornego na leki wirusa HIV. Dofinansowanie projektu DYNANETS wynosi 2,41 mln EUR.

Za: CORDIS

komentuj publikację

Czy wiesz że...?

wersja BETA

Historia medycyny jest to historia rozwoju myśli lekarskiej, metod leczenia oraz podejścia do chorego i choroby. Zależnie od okresu historycznego te metody były bardzo różne, zaś leczenie mające naukowe uzasadnienie pojawiło się dopiero około 200 lat temu. Wnioski płynące z analizy historii medycyny zapobiegają zarówno bezkrytycznemu podchodzeniu do nowych medycznych wynalazków, jak i nie uwzględnianiu nowych terapii i sposobów leczenia. pełny tekst

Badanie przesiewowe (skriningowe, skrining, z ang. screening) w medycynie to rodzaj strategicznego badania, które przeprowadza się wśród osób nie posiadających objawów choroby, w celu jej wykrycia i wczesnego leczenia, dla zapobieżenia poważnym następstwom choroby w przyszłości. pełny tekst

Gemtuzumab ozogamicyny lek cytostatyczny, obecnie wycofany z rynku, stosowany dawniej w leczeniu ostrej białaczki szpikowej u pacjentów z dodatnimi wynikami badań w kierunku receptorów CD33, u których wystąpił nawrót choroby po wcześniejszym kursie leczenia oraz którzy nie kwalifikowali się do innych typów intensywnej chemioterapii. W dniu 18 października 2000 został oznaczony jako sierocy produkt leczniczy do leczenia ostrej białaczki szpikowej. pełny tekst

Marionnet - wirtualne laboratorium sieci; umożliwia użytkownikom konfigurowanie i uruchamianie złożonych sieci komputerowych bez potrzeby fizycznego podłączania okablowania. pełny tekst

Moduł "Czy wiesz że...?" (wersja testowa, beta): definicje/pojęcia wygenerowane w obrębie tego modułu pochodzą z Wikipedii i udostępniane są na licencji Creative Commons: uznanie autorstwa, na tych samych warunkach, z możliwością obowiązywania dodatkowych ograniczeń. Dostęp do pełnej wersji każdego hasła (oraz dokładnch informacji na temat licencji, autora oraz edycji) możliwy jest po kliknięciu w odnośnik opisany jako "pełny tekst".